用生物信息学挖掘玉米中的microRNAs及其靶基因
作者： 审稿人： 时间： 2011-05-01 点击次数：次
Journal: 作物学报. 2010, 36: 1324-13 35
Author: 张志明, 宋锐, 彭华, 罗茂, 沈亚欧, 刘丽, 赵茂俊, 潘光堂
Abstract:
microRNA(miRNA)是一类内源性的、19～24碱基长度的小分子非编码RNA,通过碱基互补调控靶基因的表达,在多细胞生物的基因表达调控过程中扮演着十分重要的角色.植物中的miRNAs具有高度的保守性,这为通过同源比对发现保守的miRNAs提供了思路和途径.本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的miRNAs与玉米EST和GSS数据库的比对,并设置一系列严格的筛选标准,共筛选到23条新的玉米miRNAs;利用WMD 3在线植物miRNAs靶基因预测软件,对新发现的玉米miRNAs进行靶基因预测,总共预测到89个靶基因,进一步功能分析发现,这些靶基因参与玉米的生长发育、信号转导、转录调节、新陈代谢及逆境胁迫响应等调控过程。
Link: http://d.wanfangdata.com.cn/Periodical_zuowxb201008012.aspx
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