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玉米同义密码子偏爱性分析

作者: 审稿人: 时间: 2011-05-11 点击次数:


Journal: 农业生物技术学报.2010,18: 456-4 61

Author: 刘汉梅, 何瑞, 张怀渝, 黄玉碧

Abstract:

应用CodonW软件对玉米(Zeamays)基因组中的7402个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算了位于密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数、同义密码子的使用频率等,并确定了玉米的最优密码子。结果显示,玉米密码子第3位的G+C含量明显高于第1、2位,表现出对以G或C碱基结尾的密码子发生强烈偏向使用;且确定的27种最优密码子均以G或C碱基结尾。分析结果对指导外源基因进行分子改造,提高其在玉米中的表达效率及完善玉米基因预测软件和程序,提高新基因预测和基因组注释准确性等具有重要意义。

Link: http://www.cqvip.com/QK/97947X/201003/34430795.html

 

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